身体健康医疗大数据研究中心在国家大力推展身体健康医疗大数据研究与应用于的大形势下、几经北京大学及北京大学医学部涉及领导的长年筹划、由北京大学医学部和北京大数据研究院联合筹划创建北京大学身体健康医疗大数据研究中心。北京大学身体健康医疗大数据研究中心的宗旨是构建多源身体健康医疗大数据、使用国际前沿的数据处理和分析技术，为国家身体健康医疗战略、医学实践中和全人群身体健康管理获取大数据驱动的决策反对，同时培育行业领军人才，增进产业转化成，打造出国际一流、国内领先、产学研一体的身体健康医疗大数据平台。北京大学身体健康医疗大数据研究中心由哈佛大学麻省总医院李全政教授兼任中心主任，北京大学第一医院肾内科张路霞教授兼任常务副主任，王海波、胡永华、周晓华、谢冰和詹思延兼任副主任；另另设指导委员会、顾问委员会和专家委员会。
2017年5月，北京大学身体健康医疗大数据研究中心在医学部顺利举行北京大学医学身体健康医疗大数据论坛。此次论坛目的让医学部各学院（部）和医院更为理解中心的定位、功能和前期工作，更佳充分发挥中心在医学部的起到。中医大数据研究中心北京大数据研究院中医大数据中心，是国内首个统合了政府、大学和市场三方面资源的中医大数据中心。
中心子集北京大学、政府、各中医药大学、各大型中医院、行业企业等的优质资源，利用北京大学在人才、技术、教学等上的优势地位，挤满国际一流的专家顾问团队，将与国内外同行一道，积极开展中医大数据人才教学与培训，培育中医大数据行业领军人才，打造出国际一流的中医大数据平台，并与企业联合积极开展中医大数据分析和成果转化成，引导中医大数据产业发展，并通过大数据增进中医行业发展。中医大数据是医疗身体健康大数据的最重要内容，而中医与西医有相当大有所不同，数据提供、研究等也有其特殊性。
中医大数据的仅次于特点是必须学校与产业的紧密结合，为此，5月8日，北京大数据研究院中医大数据中心正式成立大会在北京大学举办。中心着力研发大数据采集与处置、数据挖掘分析、人工智能等中医大数据关键核心技术，创建国内领先的第三方中医大数据库和应用于平台，基于大数据面向全社会获取中医智能引擎，中西药的临床仅有流程数据服务，以及为中西药研究者获取一站式研究型服务工作。
中心分设中医人工智能平台、中西药临床服务平台、中西药临床科研一体化大数据库及分析平台。中医人工智能平台将基于中医大数据探讨中医病历的大自然语义处置、中医智能辨证论治、中医四诊治智能临床、中医名家经验挖出等方面，搭起核心人才队伍，研发核心引擎，并与行业企业一道构建成果产业化；中西药临床服务平台获取医药产品各期临床试验技术外包服务，还包括中药、化药、生物制品、保健食品、医疗器械、诊断试剂的新产品临床试验及上市后再行评价临床研究、人体药代动力学及生物等效（仿造药一致性评价）等涉及的技术外包服务。中西药临床科研一体化大数据库及分析平台主要负责管理中西药数据库的创建和确保，获取临床科研一体化服务，同时负责管理系统性搜集、整理、质控、建构和统合中药RCT、上市后再行评价、安全性数据库、科研项目的各来源数据及分析工作。
除了身体健康医疗大数据中心、中医大数据研究中心外，北京大数据研究院还正式成立了金融大数据研究中心、时空大数据协同创意中心、交通大数据研究中心、能源与环境大数据研究中心、公共安全大数据研究中心、保险大数据研究中心、农业大数据研究中心。
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